首先，可以通过采取全DNA组比对（Whole Genome Comparison）方法，根据它们都是父母的全部DNA组结构对其进行比对。这个方法具有更大的优点是可以排查多种不同类型的DNA异常，结果我们可以自己得到一个较高的准确性。但是对于一般情况下，这种方法以及成本相对较高，时间较长，而且他们只能得出我国有关父母的鉴定结果，不能得出受检者之间的关系。

其次，全染 {MOD}体配对可以用来根据染 {MOD}体的结构进行比较。这是一种独特的、比通常检测方法更快的鉴定方法，特别是对于更容易发生变异的疾病性状，可以更快地发现。然而，染 {MOD}体测序本身可能有很大的误差，因此结果也相对不精确，难以检测到大部分的 DNA 变异。

第三，血清标志物检测可以检测红细胞和浆细胞的血清标志物，然后根据血清标志物的结果判断受试者是否为同卵双生。这种方法简单、快速，可以给出快速的响应。然而，鉴定结果受到许多外部因素的影响(如环境因素、饮食习惯等。)，而且容易出现假阴性和假阳性结果。

此外，DNA 多态性可以用来和比较它们的共同和不同的特点。该方法对中山地区做亲子鉴定具有很高的敏感性。